初めまして、お世話になっております。
とても分かりやすくて素晴らしいソフトだと思いました。
報告と、何点かこういう機能があったらいいなというものがあったので書き込みさせて頂きます。。

まず、バグ報告ですが
重複ファイルリストにある長いファイル名を右クリックしてフォルダを開こうとすると、画像のようなメッセージが出て強制終了します。Windowsのシステム上の制約に近いですが、対応いただけると嬉しいです。

次に要望ですが、3点です。
一つ目は、あるフォルダの中身（サブフォルダ含めて）を「リファレンス」として、そのフォルダ内での比較は行わないようにしたいです。具体的には、3Dモデルの差分が詰まったようなフォルダがあって、そのフォルダ内の色々な場所で同じファイルを使いまわしていたりするので検索に時間がかかってしまいます。ロックフォルダとしておけば引っかかっても選択できないのでそこまで困らないのですが、ファイル量が100万弱と膨大のため検索時間が長いです。

二つ目は、同じフォルダ・ファイル構成になっているサブフォルダを検索したいです。フォルダ名は無視できると嬉しいです。

三つめは、移動先にフォルダ構成を保持するようにしたいです。難しいとのことですが、あると非常にありがたいため入れさせていただきました。

ご検討いただければ幸いです。